微型滤油机操作前将冲好孔的滤纸，仔细地夹在每个滤板、滤框之间，每层滤纸数量一般为1-2张，视过滤的要求和滤纸的质量而定，在夹放滤纸时，不要偏移造成泄漏，影响过滤效果。
滤纸在使用前应进行干燥，干燥温度120℃左右。
使用已用过的滤纸时，滤纸必须经过烘干，并应无任何破损，注意有滤渣的一面（即脏的一面）应对着滤框放置，不应对滤板，以免滤渣在这滤时被冲洗下来，污染过滤后的油液。
当过滤压力较高，发现滤纸有冲破现象时，可以在靠滤板的一面衬以滤布，以增加滤约的强度。
放好滤纸后，转动手轮将滤约板压紧，压紧板时，只许一人，并且不能加长压紧手柄进行压紧，以免损坏机器。
将取样油嘴关闭，如排油管道上用户有阀门时，应将阀门旋开。接通电动机的电源，使滤油机工作，滤油机的正常工作压力随滤油粘度大小，及排出管道的阻力而变，一般在0.05-0.3MPa范围内，过滤的初始压力较低，随着过滤时间增长，滤渣和滤纸吸收水份的增多而使压力逐渐增高，达到一定程度时（随用户对油的要求而异）应更换滤纸。
在滤油过程中，提取油样时，可以旋开油嘴取样。
停机时，先打开进气阀，待出油管无油后停机，关闭进出油阀，停止油泵，松开压紧装置，逐片的取出滤纸，清洗滤纸和滤框内滤渣，更换滤纸重新夹好压紧，盖上油箱。最后，清洗粗滤器，清洗后重新盖好拧紧螺栓，待下次再用。
